CODE – Complex Omics Digital Engine

Call for Proposals: Applications – Call II – DEVELOPMENT OF DIGITAL SOLUTIONS

Project Title: CODE – Complex Omics Digital Engine

Project Registration Number: CZ.01.01.01/01/24_062/0007640

Managing Authority: Ministry of Industry and Trade of the Czech Republic

Lead Applicant: Institute of Applied Biotechnologies a.s.

Project Partners: AnyCare s.r.o.; Biology Centre of the Czech Academy of Sciences, public research institution

Project Budget: CZK 29.547 million

Implementation Period: 1 January 2026 – 30 June 2027

The CODE – Complex Omics Digital Engine – project focuses on developing a secure and interoperable digital infrastructure for the management, analysis and long-term archiving of multi-omics data, including genomics, transcriptomics, proteomics, metabolomics and lipidomics.

The project aims to support precision medicine and biomedical research through the implementation of FAIR principles, compliance with GDPR and HIPAA requirements, automated data workflows and the use of artificial intelligence to integrate clinical and molecular information. The project consortium includes two small mid-cap companies.

The primary objective of the project is to create a robust digital infrastructure enabling the secure processing, archiving and sharing of sensitive biological data in compliance with applicable legislation, including the GDPR and HIPAA.

The project includes the design and implementation of a data repository compliant with the FAIR principles—Findable, Accessible, Interoperable and Reusable—the introduction of structured data formats such as VCF, mzML and FASTQ, and the development of a secure access interface for internal and external analytical tools and computing platforms.

The CODE project will deliver an innovative software platform for the centralised management, secure sharing and analysis of multi-omics and clinical healthcare data. The resulting system will enable the efficient integration of diverse data modalities, support standardised formats and open interfaces, and ensure a high level of data security and full regulatory compliance with the GDPR and the ISO/IEC 27001, ISO/IEC 27002 and ISO 27799 standards.

The platform will be prepared for pilot deployment at the partner institutions and will provide a foundation for the continued development of precision medicine in the Czech Republic.

Výzva: Aplikace – výzva II. – VÝVOJ DIGITÁLNÍCH ŘEŠENÍ

Název projektu: CODE – Complex Omics Digital Engine

Registrační číslo: CZ.01.01.01/01/24_062/0007640

Poskytovatel: Ministerstvo průmyslu a obchodu

Hlavní žadatel projektu: Institute of Applied Biotechnologies a.s.

Partneři projektu: AnyCare s.r.o., Biologické centrum Av ČR, v. v. i.

Rozpočet projektu: 29 547 tis. Kč

Doba realizace: 1.1.2026- 30.6.2027

Projekt CODE – Complex Omics Digital Engine – se zaměřuje na vybudování bezpečné a interoperabilní digitální infrastruktury pro správu, analýzu a archivaci multiomických dat (genomika, transkriptomika, proteomika, metabolomika, lipidomika).

Cílem je podpora precizní medicíny a biomedicínského výzkumu skrze FAIR standardy, zabezpečení dle GDPR a HIPAA, automatizaci toků a využití AI pro integraci klinických a molekulárních informací. Součástí konsorcia jsou dvě SMALL MID CAP společnosti.

Cílem projektu je vytvoření robustní digitální infrastruktury umožňující bezpečné zpracování, archivaci a sdílení citlivých biologických dat v souladu s platnou legislativou (např. GDPR, HIPAA).

Projekt zahrnuje návrh a implementaci datového skladu kompatibilního se standardy FAIR (Findable, Accessible, Interoperable, Reusable), zavedení strukturovaných datových formátů (např. VCF, mzML, FASTQ), a vývoj zabezpečeného přístupového rozhraní pro interní i externí analytické nástroje a výpočetní platformy.

Projekt CODE přinese inovativní softwarovou platformu pro centralizovanou správu, bezpečné sdílení a analýzu multiomických a klinických dat ve zdravotnictví. Výstupem bude systém, který umožní efektivní integraci různorodých datových modalit, podporu standardizovaných formátů a otevřených rozhraní, a zároveň zajistí vysokou úroveň zabezpečení a plný legislativní soulad dle GDPR a norem ISO/IEC 27001, 27002 a 27799.

Platforma bude připravena k pilotnímu nasazení v partnerských institucích a umožní další rozvoj precizní medicíny v ČR.